Ngay từ khi Pokemon GO tạo nên cơn sốt trên toàn thế giới trong thời điểm ra mắt, đã có những ‘thuyết âm mưu’ khá nực cười về việc tựa game con cưng của Niantic là một phần mềm gián điệp thu thập thông tin trái phép của người dùng hay về những địa điểm nhạy cảm (căn cứ quân sự) của các quốc gia trên thế giới. Mặc dù chẳng có bất kỳ bằng chứng cụ thể nào để chứng minh cho thuyết âm mưu trên nhưng không ít quốc gia vẫn có sự đề phòng không hề nhỏ với tựa game này
Cho đến thời điểm hiện tại, Pokemon GO vẫn chưa hề được cấp phép hoạt động tại Trung Quốc với lý do tựa game này là mối đe dọa an ninh về thông tin địa lý, vận tải và an toàn cá nhân của người dùng. Còn tại Nga, trong một vài tháng gần đây, rất nhiều người chơi Pokemon GO đã phản ánh rằng công cụ GPS trên điện thoại di động của họ đã đang hiển thị … sai vị trí hoàn toàn và họ hoàn toàn bất lực trong việc chơi Pokemon GO.
Cách đây 2 ngày, Niantic đã có một thay đổi nhỏ về chính sách sử dụng trong đó có đề cập đến việc Pokemon GO sẽ có quyền lấy thông tin từ những ứng dụng khác được cài đặt trên điện thoại của người dùng. Và điều này ngay lập tức gây nên tranh cãi khi mà rất nhiều người đặt dấu hỏi cho việc thu thập thông tin mờ ám này. Chẳng có mấy game thủ quan tâm đọc kỹ chính sách sử dụng và họ mặc định cho việc Pokemon Go muốn làm gì thì làm trên điện thoại của họ. Đến thời điểm hiện tại, Niantic chưa đưa ra bất kỳ phản hồi chính thức nào về việc thay đổi ‘nhỏ’ này.