Trong phần trước..
Vâng thánh thần... ngay cả là một thánh thần cuồng sát, cuối cùng cũng nằm dưới tay kẻ phàm trần.Hợp chất cao su pha bụi phóng xạ Kryptonite ngay khi tiếp cận với tròng mắt của Superman đã khiến Man of Steel bất tỉnh, rơi thẳng từ trên không xuống dưới lòng nước. Thời khắc ấy đánh dấu việc Justice League dù mang quyền năng ngất trời vẫn bị đánh bại bởi một kẻ chẳng hề có siêu năng lực. Nhưng như Batman từng nói với người bạn đến từ Kryton, cuộc chiến này người thắng không phải anh và tôi. Cuộc chiến này người thắng là kẻ đã khiến toàn bộ Justice League quay mặt lại với anh. Kẻ đó không ai khác ngoài "Hoàng tử của tội ác" - Joker.
Sau cuộc chiến kinh thiên với Justice League, Batman khám phá ra rằng Joker đầu độc họ bằng một loại chất độc đặc biệt.. đặc biệt đến mức nó được tùy biến cho mỗi người, độc nhất với mỗi nhân cách mà nó lây nhiễm. Toàn bộ thành viên Justice League lập tức được đưa vào điều trị và dần ổn định hơn. Nhưng Batman biết phải mất 5 ngày độc tính mới tan hết. 5 ngày, tức là gần một tuần thế giới không có sự bảo vệ của Justice League. Gần một tuần mà Joker có thể rảnh tay làm bất cứ thứ gì mình muốn. Để điều tra sâu hơn về tung tích Joker - kẻ những tưởng như đã chết ở phần trước, Batman đến thăm buồng giam cũ của gã hề tại Arkham Asylum. Tại đây Hiệp sỹ bóng đêm gặp Eric Border - một người cũ từng làm việc tại Arkham Asylum trước khi viện thương điên bị phá hủy và chuyển cơ sở sang biệt thự Wayne. Trong khi trò truyện như những người bạn cũ với Eric, Batman bước chân vào phòng giam nơi từng khóa chân gã hề điên loạn. Nhưng vị siêu anh hùng không biết từ đằng sau lưng Eric Border bắt đầu cởi tấm áo blouse trắng, để lộ bộ vest đen óng phía bên trong. Bình tĩnh... chậm rãi... gã đóng sập chấn song, khóa cứng Batman ở bên trong. Dưới ánh sáng le lói, cựu nhân viên của Arkham Asylum dần dần đưa tấm khăn tay lên lau mặt, để lộ ra làn da trắng bệch cùng nụ cười điên dại. Vâng, kẻ vốn tự xưng Eric Border lại chính là Joker.
Từ trong buồng giam Batman dần dần bị tê liệt bởi khí độc, nhưng hoàn toàn không phải thứ từng danh cho Justice League. Joker muốn Batman sống, sống để chứng kiến toàn bộ Gotham trở nên điên dại trong khi anh ngủ vùi trong nơi từng giam giữ kẻ thù của mình, sống để rồi chết một lần và mãi mãi.. Vì như Joker nói, hắn đã cảm thấy buồn chán với "người bạn của mình" và đã đến lúc mang "mối quan hệ này đến một kết cục không bao giờ có thể quay lại". Khi tỉnh lại, toàn bộ khung cảnh trước mắt anh diễn ra đúng như lời Joker hứa, nơi chất độc dị biệt lan tràn khắp mọi nơi và lây nhiễm chủng virus biến tình yêu của con người trở thành nỗi căm thù điên dại và sự thèm khát bạo lực đến tột cùng. Nhưng trong tất cả những người nhiễm virus may mắn Batman vẫn có một đồng minh an toàn là James Gordon. Khóa mình trong căn hộ, ông trợ giúp Batman bằng cách điều tra những vụ việc xảy ra xuyên suốt lịch sử của thành phố. Vì một lý do nào đó, ông thấy gương mặt Joker hiện diện khắp mọi nơi. Trên mặt báo và trong những bức ảnh, ẩn mình giữa những tài liệu về các vụ thảm sát diễn ra cả trăm năm về trước. Ở đó luôn luôn có một gương mặt tái mét và một nụ cười điên đại hiện hữu. Tại sao? Làm sao có chuyện này? Joker bất tử? Không, không thể nào.
Cùng lúc đó Batman đến bệnh viện bất chấp "đàn zombie" nhiễm virus Joker bủa vây khắp mọi ngóc ngách. Mục đích của anh là điều tra "Patient Zero" - kẻ đầu tiên bị nhiễm bệnh. Nhưng anh không hề biết Patient Zero ấy chính là Joe Chill, tên cướp đã sát hại cha mẹ mình năm xưa. Khi còn chưa kịp hoàn hồn vì kẻ thay đổi cuộc đời mình hiện ra trước mắt thì đằng sau tấm kính cách ly hiện nên một phiên bản sân khấu của Crime Alley, nơi mà Thomas và Martha Wayne từng nằm xuống. Và ở đó cũng có một gia đình vô danh với ông bố, bà mẹ và đứa con... như chính gia đình cậu bé Bruce Wayne ngày nào. Đằng sau tấm kính, Joe Chill với nụ cười điên dại bắt đầu thò tay vào khẩu súng ở túi áo trong, mong muốn tái hiện lại cảnh tượng khủng khiếp năm xưa từng ám ảnh một linh hồn vô tội. Duy chỉ có lần này hắn muốn thêm một linh hồn vô tội khác. Quay trở về với Gordon, khi đang một mình trong căn hộ ông bất giác nghe thấy tiếng động lạ. Rút súng bước gần đến tủ quần áo, ông mở cánh cửa ra để rồi bị knock-out bởi món găng tay đồ chơi không hiểu vì sao lại ở đó. Đau đớn trên sàn nhà, ngài ủy viên Gordon hãi hùng nhận ra một bóng đen từ dưới gầm giường bò ra. Vâng, chẳng ai khác ngoài Joker, kẻ vốn nằm trong căn hộ của Gordon suốt bấy lâu nay. Trườn đến như một con quái vật, hắn mang cây rìu trong tay toan kết liễu Gordon.
Trong cùng thời điểm ấy có 2 viên đạn được bắn ra. Một từ nòng súng của Joe Chill ở bệnh viện Giáo hội Gotham, một từ nòng súng của Gordon trong căn hộ tăm tối. Của Joe Chill thì găm vào ngực Batman, người vừa kịp thời lao tới để bảo vệ gia đình vô tội... của Gordon thì găm thẳng vào ngực Joker, kẻ đứng đó với lưỡi rìu lăm lăm trong tay. Với bộ giáp tối tân, Batman bình yên vô sự.... với lớp áo nhàu nhụa, Joker phủ phục dưới ngọn súng của ngài ủy viên cảnh sát. Batman gọi cho Gordon, và ông không thể giấu nổi niềm vui sướng tột độ của mình. Ông nói mà nước mắt hạnh phúc chảy ròng trên má.
"Batman, hắn chết rồi.. chết thật rồi..""Jim..?..""Tôi phải làm thế! Hắn tấn công và tôi chỉ tự về mà thôi!... Hắn chết rồi, chết thật rồi..""Tôi biết, tôi biết.. nó có vẻ lạnh lùng. Tôi biết căn hộ đang cháy rụi, nhưng chí ít.. chí ít thì hắn cũng đã chết." Nhưng Gordon không biết, từ trong ngọn lửa đang cháy hừng hực sau lưng mình, Joker dần dần đứng dậy như một thây ma.