Game Pokémon có một điểm giống nhau, đó là việc mẹ của nhân vật chính thường là người tiễn họ, tuy nhiên, cha của nhân vật chính dường như lại mất tích bí ẩn trong hầu hết các phiên bản.
Một số người cha xuất hiện trong series Pokémon như Giáo sư Birch của thế hệ III, cha của May, và Meyer – cha của Bonnie với Clemont – từ anime Pokémon the Series: XY. Tuy nhiên, ngoài những nhân vật như thế này, Pokémon còn thiếu vắng đi rất nhiều người cha. Trong game, mẹ của nhân vật chính thường xuyên nhắc đến cha của họ, nhưng nơi ở chính xác của ông hầu như lại không được chúng ta biết tới.
Nhiều trò chơi về Pokémon bắt đầu như thế này: Nhân vật chính chuyển đến một thị trấn mới cùng với mẹ của mình, mẹ là người thường giải thích rằng gia đình phải chuyển đến đây do chuyện công việc của cha. Nhân vật chính sau đó gặp mặt giáo sư của khu vực này, họ nhận được một Pokémon cho riêng mình, và sau đó nhân vật chính được mẹ tiễn khi họ bắt đầu cuộc hành trình của mình. Sau khi ra ngoài thế giới phiêu lưu một thời gian, người chơi có thể trở về nhà bất cứ lúc nào để thăm mẹ, nhưng cha của họ dường như lại không bao giờ xuất hiện tại nhà mới.
Người hâm mộ đã đưa ra nhiều giả thuyết trên Reddit về những gì đã xảy ra với các người cha trong Pokémon và lý do tại sao mà sau nhiều năm, vẫn chưa có lời giải thích chính thức nào từ nhà phát triển. Những giả thuyết này bao gồm cả việc Chiến tranh Pokémon xảy ra đã cướp đi sinh mạng của nhiều chàng trai trẻ ở khắp các khu vực, một cuộc chiến như vậy diễn ra và những người cha phải tham gia vào, có thể khiến cho cha mẹ của nhân vật chính ly hôn. Đặc biệt đối với Pokémon Sword and Shield, có một giả thuyết nổi tiếng rằng mẹ của nhân vật chính là một bà mẹ đơn thân, vì cha của họ không hề được nhắc đến.
Game Pokémon chỉ cho chúng ta thấy cha của nhân vật chính một lần
Có đúng một người cha xuất hiện trong game, đó là ở Pokémon Ruby and Sapphire và Pokémon Emerald, cha của nhân vật chính tên Norman, thủ lĩnh nhà thi đấu hệ Thường tại Petalburg. Là thủ lĩnh nhà thi đấu đầu tiên mà người chơi phải đối mặt, nhưng Norman sẽ từ chối chiến đấu cho đến khi chúng ta tích lũy đủ bốn chiếc huy hiệu từ các nhà thi đấu khác. Norman không bao giờ xuất hiện tại nhà của nhân vật chính và chúng ta cũng chưa bao giờ được thấy anh ta tương tác với mẹ của họ một lần nào.
Mặc dù điều này chưa bao giờ được Game Freak thảo luận tới, nhưng lý do mà có rất ít người cha xuất hiện trong các game Pokémon có thể chỉ đơn giản là do họ đang làm việc, hoặc quá bận rộn đúng vào những khoảng thời gian mà nhân vật chính về thăm nhà. Dù thế nào đi chăng nữa, việc thiếu vắng các người cha trong series Pokémon có thể sẽ vẫn luôn là một bí ẩn!